Amos Onasanya
Proteomika jest obecnie coraz częściej uznawana za użyteczną technikę pozwalającą na ujawnienie różnorodności genetycznej wśród różnych izolatów bakterii, umożliwiającą odróżnienie żywych patogenów od martwych. Niniejsza praca przedstawia zatem różnorodność proteomiczną trzydziestu izolatów Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) - czynnika wywołującego bakteryjną plamistość liści ryżu w Afryce Zachodniej - z wykorzystaniem analizy izozymowej metodą elektroforezy w żelu poliakrylamidowym (PAGE). Badanie ujawniło 23 loci izozymów, w których gen SKDH wykazywał polimorfizm na poziomie 33,3-93,3%, natomiast geny EST i G6PH wykazywały polimorfizm na poziomie 40-96,7% w profilu enzymatycznym izolatów Xoo. Analiza relacji filogenetycznych między 30 izolatami Xoo ujawniła dwie główne grupy genetyczne (Xoo-A i Xoo-B), z których każda składa się z dwóch podgrup (Xoo-A1 i Xoo-A2) oraz (Xoo-B1 i Xoo-B2). Charakterystyczny wzór każdego izolatu sugerował wysoki poziom zmienności genetycznej oraz częste występowanie mutantów w izolatach Xoo w różnych komórkach gospodarza. Informacje te powinny okazać się szczególnie przydatne dla hodowców ryżu, patologów ryżu, epidemiologów chorób ryżu, biotechnologów zajmujących się ryżem oraz społeczności naukowej dążącej do opracowania trwałych odmian ryżu odpornych na Xoo, przeznaczonych dla różnych regionów Afryki Zachodniej.
