Étude DFT de l’oxydation du formamide et du thioformamide par la xanthine oxydase

Ce texte présente un compte rendu mathématique rigoureux des principes de la chimie computationnelle en chimie biophysique, en particulier appliquée à la recherche de nouveaux inhibiteurs de la xanthine oxydase ayant moins d’effets secondaires et des activités puissantes dans la conception de médicaments pour le traitement de la goutte. L’hydroxylation des purines est catalysée par la xanthine oxydase et les purines se dégradent en adénosine triphosphate (ATP), ce qui entraîne l’accumulation d’adénosine diphosphate (ADP) et d’adénosine monophosphate (AMP), qui se dégradent ensuite en acide urique qui, en quantités plus importantes, provoque la goutte. Par conséquent, l’inhibition de la xanthine oxydase réduit la production d’acide urique, ce qui permet de traiter la goutte. Le niveau de calcul de la théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT)/B3LYP avec l’ensemble de base de 6-31G (d’, p’) et LANL2DZ/LANL2 est utilisé pour modéliser la réaction complexe de la xanthine oxydase et du substrat, l’optimisation de la géométrie, la recherche de l’état de transition, la voie mécaniste de la réaction, le calcul de l’énergie libre, les affinités de liaison des ligands, le calcul des propriétés moléculaires, et enfin pour étudier la puissance des ligands Formamide et Thioformamide en tant qu’inhibiteurs de la xanthine oxydase.